W trakcie wizyty w Estonii warto odwiedzić tutejsze muzea, na przykład Muzeum Morskie w Tallinie. Można w nim obejrzeć między innymi modele statków pirackich z XVIII w., dawne przyrządy nawigacyjne i makiety latarni morskich. Zbiory prezentowane są w dwóch budynkach: Paks Margareeta oraz Lennusadam.
W Tallinie działa także Estońskie Muzeum Sztuki Kumu, do którego powinni zajrzeć wielbiciele sztuki nowoczesnej. Siedziba instytucji znajduje się w parku Kadriorg, na wzgórzu Lasnaberg. Muzeum umożliwia zapoznanie się z licznymi dziełami, a jednocześnie pełni funkcję edukacyjną. W budynku mieści się także sklep z pamiątkami oraz kawiarnia.
W Tartu, drugim co do wielkości mieście Estonii, można odwiedzić Muzeum Zabawek. To miejsce, które przyciąga uwagę nie tylko dzieci, ale i dorosłych. Goście mogą tu obejrzeć między innymi lalki, misie, domy dla lalek, samochodziki oraz modele kolejek. Dzieci mają możliwość wzięcia udziału w ciekawych warsztatach, pobawienia się w teatr kukiełkowy, namalowania obrazu i przymierzenia pięknych strojów.